Gurur duyacağınız özellikler Genomik Yapay Zeka Bulutu

Geniş analiz yelpazesi

Gen Paneli, Ekzom, Genom, RNA-Seq ve Metagenom verileriniz güvenilir bir şekilde işlenmektedir.

Güçlü donanım

Verileriniz yeterli üst düzey teknik donanım ve tecrübeli profesyonellerimiz tarafından en hızlı ve doğru yöntemler ile analiz edilmektedir.

Uygun ücretlendirme

Analizleriniz uluslararası muadili hizmet sağlayıcılarından çok daha uygun bir bedelle yapılmaktadır.

Verinin ülke sınırlarında kalması

Elde ettiğiniz protokol numarası ile saklanan genomik tabanlı veriler karşılıklı sözleşme ile ülke içinde kalma garantisindedir.

Örnek sayınıza, gen paneli, tüm ekzom, tüm genom, metagenom, RNA-Seq analiz ihtiyacınıza göre özel fiyat teklifi alabilirsinizŞimdi Dene

Çözüm Ortaklarımıza Sunduğumuz Özel Çözümler

Hastalar

Negatif rapor mu aldınız? FastQ, Bam veya VCF dosyanız ile hızlıca ve güvenlice internet erişimi olan her yerden sonuç analiz imkanı. Hastalığınız ile ilgili genetik danışmanlık için de başvurabilirsiniz.

BAŞVUR

Doktorlar

Hastalarınızın kliniğini takip edebilir, dilerseniz aynı fenotipte başka vakaları takip eden hekimlerle ortak çalışma yapabilir, hasta sonuçlarına başka bir çözüme ihtiyaç duymadan ulaşabilirsiniz.

BAŞVUR

Hastaneler

Tüm hekimlerinize ait hastaları takip edebilir, doktorlarınıza ayrı giriş verebilir, gen paneli, ekzom, tüm genom, rna-seq, metagenom analizlerini özel indirimlerli fiyatlarla otomatik yapabilirsiniz.

BAŞVUR

People First, Security Always

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

SON BİLGİLER pairend

Ekzom analizi

Biyomedikal tanı, hastalık modelleme, risk analizi ve ilaç tepkisinin ölçülmesi için sıklıkla kullanılan ekzom “exome” ve SNP verilerinin biyoinformatik analizleri PairEnd ile çok daha güvenilr ve hızlı.

17 Nisan 2019

devamı...

Biyomedikal analizler

İnsan genom projesinin tamamlanması ve NGS teknolojilerinin geliştirilmesi ile beraber biyoinformatik yaklaşımlar özellikle biyotıp alanında kullanılmaktadır. Bu amaçla PairEnd sağlık alanında; Bireylerden toplanan biyokimyasal, fenotipik, metabolik ve genetik verilerin birarada değerlendirilmesi ve bu sayede hassas tanı imkanı sunmaktadır. Hassas tıp uygulamaları için çözümler sağlamaktadır. Özellikle kanser gibi kompleks hastalıkların tanı ve teşhisinde ilgili gen panelleri […]

17 Nisan 2019

devamı...

Özel çözümler

PairEnd proje özelinde standart ve ileri düzey biyoinformatik analizler sağlamaktadır. NGS datasının işlenmesi ve veri madenciliğinin yanısıra aşağıda sunulan hizmetler ile çözüm ortaklığınızı yapmaktadır; Mikroarray analizleri Biyoistatistik analizleri (ANOVA, Regresyon, Cox vb) Molekuler evrim analizleri CRISPR klon sgRNA dizaynı CRISPR off-target analizi Transkripsiyon faktor tespiti ve analizi Promoter ve diğer genetik element analizleri Pipeline hazırlanması […]

11 Şubat 2019

devamı...

Hassas tıp için NGS

“Precision medicine-Hassas tıp” NGS in en önemli kullanım alanlarından birisi olup bireye ait birçok bulgu ile beraber genetik verilerin analiz edilmesine dayanır. PairEnd hassas tıp uygulamalarında biyoinformatik yaklaşımlar sunmak için yanınızda.

08 Ocak 2019

devamı...

Genomik analizler

NGS platformaları kullanılarak üretilmiş olan genom düzeyindeki dizilemeler için aşağıda verilen analiz hizmetleri PairEnd tarafından sunulmaktadır: Genom de novo asemblisi (birleştirme) Genom haritalama Genom atıflandırması (annotasyonu) Kopya sayısı varyasyonu (CNV) Amplikon dizi analizi Degradom analizi Populasyon analizleri (haplotip yapı ve sıklığı, LD) Karşılaştırmalı genom analizleri Sinteni analizleri Transpozon belirleme ve sınıflandırılması Tekrar element analizleri Moleküler […]

15 Aralık 2018

devamı...

Epigenomik & Metagenom analizleri

Epigenom ve metagenom dizilemelerinin sonuçları PairEnd tarafından hizmet kapsamına alınmaktadır. Aşağıda örneği verilen analiz hizmetlerini alabilirsiniz. ChIPseq data analizi Metilasyon profilleme analizi (RADseq/MeDIPseq) 16s rRNA profilleme Mikrobiyal tüm genom assemblisi

21 Kasım 2018

devamı...

Data analiz hizmetleri

Biyoinformatik analiz hizmetleri Veri analizi ve yorumlanması Biyolojik problemlerin çözülmesine yönelik yeni nesil yöntemler kullanılarak elde edilen verilerin değerlendirilmesi ve analizi Tıp-ziraat-eczacılık-moleküler biyoloji-veterinerlik-mikrobiyoloji disiplinlerine yönelik elde edilen genomik, transkriptomik, epigenomik ve istatistiksel verilerin birarada ve/veya özel olrak değerlendirilmesi Moleküler ıslah süreçlerinde genotip ve fenotip verilerinin kullanılması Moleküler evrim, filogeni, moleküler yaş, türleşme ve genom duplikasyonlarının […]

09 Ekim 2018

devamı...

Transkriptomik analizler

RNA sekanslaması yaklaşımları kullanılarak elde edilen kodlanan ve kodlanmayan transcriptlerin ve gen ifade profillemelerinin yapıldığı hizmetlerimiz; Transkriptom de novo asemblisi (birleştirme) Referans genom kullanılarak transkriptom haritalama Küçük RNA (sRNA) haritalama RNAseq analizi RNA yapı ve modifikasyon analizi Transkriptom atıflandırması (annotasyonu) sRNA (miRNA da dahil) atıflandırması (annotasyonu) Long non-coding RNA (lncRNA) karakterizasyon ve analizleri Gen ifadesi […]

23 Eylül 2018

devamı...

Biyoinformatik hizmetler

Tıp, ziraat, eczacılık, moleküler biyoloji, veterinerlik ve mikrobiyoloji disiplinlerine yönelik elde edilen genomik, transkriptomik, epigenomik ve istatistiksel verileri birarada ve/veya özel olarak değerlendiriyoruz.

15 Eylül 2018

devamı...

Kanser paneli ve serbest (cf)DNA analizleri

PairEnd özellikle kanser ile ilişkili gen panelleri kullanılarak elde edilen NGS verilerinin değerlendirilmesine ve kanda dolaşmakta olan cfDNA nın tespit edilmesini sağlayan bulguların analizlerine özel çözümler sağlamaktadır.

29 Ağustos 2018

devamı...

Araştırmaya yönelik biyoinformatik analizler

Tüm genom düzeyinde analizler (de novo ve re-sequencing) Genetik haritalama ve moleküler markör tespiti Yeni nesil dizileme ve KASP, qRT-PCR, TaqMan temelli genotipleme analizleri Populasyon genetiği çalışmalarının yorumlanması Genom editing teknolojisinin kullanılmasına yönelik kılavuz sgRNA dizaynı ve CRISPR uygulaması sonrasında off-target analizleri Gen ifadesi ölçümleri ve karşılaştırmalı ifade analizleri (heatmap, cluster, fold change vb) Kodlanmayan […]

23 Ağustos 2018

devamı...

Analiz edilmesi gereken Yeni Nesil Dizileme (NGS) datanız mı var?

NGS teknolojisi sağladığı avantajlar sebebiyle günümüzde sıklıkla kullanılmaktadır. Ancak, üretilen veri “Big Data” kategorisine girmekte ve projeye özgü çözümler ve analiz yaklaşımları gerektirmektedir. PairEnd bu noktada NGS verilerinizin amacına uygun, hızlı ve verimli bir şekilde analiz edilmesi amacıyla yanınızda. Bunun için tek yapmanız gereken ham (raw) (FASTQ) veya hizalanmış (aligned) (SAM or BAM) veriyi ya da VCF’i […]

16 Ağustos 2018

devamı...

PairEnd ile çalışmak için 5 harika sebep

i) Hızlı ve etkin çözüm. ii) Teknik ve profesyonel donanım. iii) Uygun ücretlendirme. iv) Çok geniş genomik ve transkriptomik analiz pörtföyü. v) Verinin ülke sınırlarında kalmasını sağlayan karşılıklı sözleşme.

13 Ağustos 2018

devamı...

PairEnd ile Neler Yapabilirim? Hizmetler

NGS Analiz Platformu

  • Hangi uzantılı dosyaları gönderebilirim?
    FastQ, Bam ve VCF dosyalarınız ile analiz yapabiliriz.
  • Aynı analizi tekrar yaptırmak istersem ücret öder miyim?
    Hayır, analiz sistemlerimizi sürekli güncelliyor ve geliştiriyoruz. Aynı analiz için tekrar ücret ödemezsiniz.
  • Yüklediğim dosyaların boyutuna göre ücret öder miyim?
    Hayır,
    Sistem yüklediğiniz dosyanın özelliklerini otomatik algılar ve sizi seçebileceğiniz, satın alabileceğiniz analizlere yönlendirir.
    Analizler basamak basamak, ihtiyacınıza göre gerçekleştirilir.

Genomik Analiz

  • Genom de novo asemblisi (birleştirme)
  • Genom haritalama
  • Genom atıflandırması (annotasyonu)
  • Kopya sayısı varyasyonu (CNV)
  • Amplikon dizi analizi
  • Degradom analizi
  • Populasyon analizleri (haplotip yapı ve sıklığı, LD)
  • Karşılaştırmalı genom analizleri
  • Sinteni analizleri
  • Transpozon belirleme ve sınıflandırılması
  • Tekrar element analizleri
  • Moleküler markör (SNP/SSR/CAPS vb) geliştirlmesi
  • GWAS genom düzeyinde ilişkilendirme “genome wide association” analizi
  • GBS “genotyping by sequencing” analizi
  • Linkage haritalama ve kromozom ankoring anallizi
  • QTL hatiralama analizleri
  • Molekuler evrim analizleri

Biyomedikal Analiz

  • Diyagnostik amaçlı veri değerlendirme
  • Genetik element tespiti
  • Kişiselleştirilmiş tıp çözümleri
  • Hassas veri analizi
  • Hastadan alınan biyokimyasal, fenotipik, metabolik ve genetik verilerin birarada değerlendirilmesi ve bu sayede hassas tanı imkanı
  • Fenotipik, metabolik ve genetik verilerin birarada değerlendirilerek hastalık yatkınlığı ve tahminlenmesi
  • Gen panellerinden elde edilen verilerin hızlı ve etkin analizi
  • Ekzom dizilerinin tanı/tespit mutasyon/CNV hedelerine yönelik değerlendirilmesi
  • Mendelyan hastalıkları analizleri
  • Kompleks hastalıklar analizleri
  • Kanser analizi (SNP/mutasyon/InDel analizleri)
  • VCF üretilmesi

Transkriptomik Analiz

  • Transkriptom de novo asemblisi (birleştirme)
  • Referans genom kullanılarak transkriptom haritalama
  • Küçük RNA (sRNA) haritalama
  • RNAseq analizi
  • RNA yapı ve modifikasyon analizi
  • Transkriptom atıflandırması (annotasyonu)
  • sRNA (miRNA da dahil) atıflandırması (annotasyonu)
  • Long non-coding RNA (lncRNA) karakterizasyon ve analizleri
  • Gen ifadesi profilleme
  • Gen ontoloji analizi
  • KEGG yolak analizi

Epi/Meta-genom ve Barkotlama Analizleri

  • ChIPseq data analizi
  • Metilasyon profilleme analizi (RADseq/MeDIPseq)
  • 16s rRNA profilleme
  • Mikrobiyal tüm genom assemblisi
  • Meta barkotlama

Araştırma Bulgum Var

  • Tüm genom düzeyinde analizler (de novo ve re-sequencing)
  • Genetik haritalama ve moleküler markör tespiti
  • Yeni nesil dizileme ve KASP, qRT-PCR, TaqMan temelli genotipleme analizleri Populasyon genetiği çalışmalarının yorumlanması
  • Genom editing teknolojisinin kullanılmasına yönelik kılavuz sgRNA dizaynı ve CRISPR uygulaması sonrasında off-target analizleri
  • Gen ifadesi ölçümleri ve karşılaştırmalı ifade analizleri (heatmap, cluster, fold change vb)
  • Kodlanmayan RNA ların organizma, doku, hücre tiplerinde dizileme verisinden tespit edilmesi ve analizi
  • Küçük RNA (miRNA, siRNA, eTM) veri setlerinin değerlendirilerek bu moleküllerin annote edilmesi, ifade analizi, hedef gen tayini ve fonksiyonel karakterizasyonu
  • Moleküler markör (SNP/SSR/CAPS vb) geliştirlmesi
  • GWAS genom düzeyinde ilişkilendirme “genome wide association” analizi
  • GBS “genotyping by sequencing” analizi
  • Linkage haritalama ve kromozom ankoring anallizi
  • QTL hatiralama analizleri
  • Molekuler evrim analizleri

Proje ve Veri Madenciliği Danışmanlığı

  • Planlamış olduğunuz çalışmanın en uygun yöntem ve yaklaşımlar ile yürütülerek sonuçlandırılmasında gerekli danışmanlık hizmeti sunulmaktadır.

Veri Tabanı Kurulumu

  • Proje özelinde belirlenecek kategorize edilmesi gereken web-tabanlı sorgulama yapılabilen databankası kurulumu hizmeti sağlanmaktadır.

Script ve Pipeline Geliştirme

  • Proje özelinde belirlenecek olan özgün yaklaşım, script ve pipeline çalışmaları yapılmaktadır.

Genetik Danışmanlık için İletişime geçin