Genomik analizler

Post by: on Aralık 15, 2018 | 0 Comment

NGS platformaları kullanılarak üretilmiş olan genom düzeyindeki dizilemeler için aşağıda verilen analiz hizmetleri PairEnd tarafından sunulmaktadır:

  • Genom de novo asemblisi (birleştirme)
  • Genom haritalama
  • Genom atıflandırması (annotasyonu)
  • Kopya sayısı varyasyonu (CNV)
  • Amplikon dizi analizi
  • Degradom analizi
  • Populasyon analizleri (haplotip yapı ve sıklığı, LD)
  • Karşılaştırmalı genom analizleri
  • Sinteni analizleri
  • Transpozon belirleme ve sınıflandırılması
  • Tekrar element analizleri
  • Moleküler markör (SNP/SSR/CAPS vb) geliştirlmesi
  • GWAS genom düzeyinde ilişkilendirme “genome wide association” analizi
  • GBS “genotyping by sequencing” analizi
  • Linkage haritalama ve kromozom ankoring anallizi
  • QTL hatiralama analizleri
  • Molekuler evrim analizleri