Araştırmaya yönelik biyoinformatik analizler
- Tüm genom düzeyinde analizler (de novo ve re-sequencing)
- Genetik haritalama ve moleküler markör tespiti
- Yeni nesil dizileme ve KASP, qRT-PCR, TaqMan temelli genotipleme analizleri Populasyon genetiği çalışmalarının yorumlanması
- Genom editing teknolojisinin kullanılmasına yönelik kılavuz sgRNA dizaynı ve CRISPR uygulaması sonrasında off-target analizleri
- Gen ifadesi ölçümleri ve karşılaştırmalı ifade analizleri (heatmap, cluster, fold change vb)
- Kodlanmayan RNA ların organizma, doku, hücre tiplerinde dizileme verisinden tespit edilmesi ve analizi
- Küçük RNA (miRNA, siRNA, eTM) veri setlerinin değerlendirilerek bu moleküllerin annote edilmesi, ifade analizi, hedef gen tayini ve fonksiyonel karakterizasyonu
- Moleküler markör (SNP/SSR/CAPS vb) geliştirlmesi
- GWAS genom düzeyinde ilişkilendirme “genome wide association” analizi
- GBS “genotyping by sequencing” analizi
- Linkage haritalama ve kromozom ankoring anallizi
- QTL hatiralama analizleri
- Molekuler evrim analizleri
Categories:Özel Çözümler